不同方法鉴定差异显示技术RAP-PCR得到差异基因的比较

时间:2023年03月03日

/

来源:深深

/

编辑:本站小编

收藏本文

下载本文

以下是小编为大家整理的不同方法鉴定差异显示技术RAP-PCR得到差异基因的比较,本文共6篇,仅供参考,欢迎大家阅读。本文原稿由网友“深深”提供。

篇1:不同方法鉴定差异显示技术RAP-PCR得到差异基因的比较

不同方法鉴定差异显示技术RAP-PCR得到差异基因的比较

目的:评价用RAP-PCR法从测序胶上得到深海细菌(Shewanella piezotolerance WP3)差异片段验证的'最佳方法.方法:用RT-PCR,RNA点杂交,荧光实时定量PCR对不同盐浓度的差异片段进行对比实验.结果:3种方法均能检测到片段的差异表达:RT-PCR灵敏性最强,RNA点杂交需要的RNA量最大,荧光实时定量PCR精确性最高.结论:在实验条件允许下,用荧光实时定量PCR对较少片段的验证较好.

作 者:李升康 王玉桥 LI Sheng-kang WANG Yu-qiao  作者单位:李升康,LI Sheng-kang(汕头大学理学院生物系,广东,汕头,515063;国家海洋局第三海洋研究所生物遗传资源重点实验室,福建,厦门,361005)

王玉桥,WANG Yu-qiao(国家海洋局第三海洋研究所生物遗传资源重点实验室,福建,厦门,361005)

刊 名:汕头大学医学院学报 英文刊名:JOURNAL OF SHANTOU UNIVERSITY MEDICAL COLLEGE 年,卷(期): 22(2) 分类号:Q939 关键词:Shewanella piezotolerance WP3   差异显示   RAP-PCR方法   差异片段,验证  

篇2:mRNA差异显示方法研究进展

mRNA差异显示方法研究进展

[关键词] DD-PCR 骨科学 研究

健康网讯:

马庆军 100083 北京医科大学第三医院骨科

党耕町 100083 北京医科大学第三医院骨科

宋国立 美国加州大学圣地亚哥分校骨科与生物工程系

哺乳动物细胞约有100?000个不同的基因,在一定时间、空间中仅有10%~15%的基因表达,这种表达受到严格调控[1]。运用mRNA 差异显示(differential display,DD)方法[2],可将不同细胞类型或同一细胞在不同环境下表达的基因进行比较,从分子生物学水平上提供信息,这对理解细胞的生命过程极有帮助。该技术一经问世,立即得到广泛应用,但同时也遇到许多问题,所以Debouck[3]曾对该方法提出质疑。现将DD的研究进展简要综述如下。

一、DD方法基本原理

DD的基本原理是将具有可比性的细胞在某一条件下可表达的mRNA 群体通过逆转录方法变成相应的cDNA 群体,以此为模板,利用一对特殊引物,即3?anchor 引物和5?arbitrary引物,在一定条件下进行PCR扩增,得到与mRNA相对应的“标签”(tags),然后用变性聚丙烯酰胺测序胶分析其差别,将有差别的基因克隆化,进一步分析其结构与功能。DD依赖三种技术:(1)mRNA逆转录技术;(2)以特定引物进行的`PCR技术;(3)DNA测序胶电泳技术。

二、DD方法的优点及其应用

用某一方法来寻找mRNA表达的差异,至少要满足下列要求:(1)在一定时间、空间里,每一个细胞约有15 000种mRNA表达,其中除少数属高丰度表达外,大量的属于低丰度表达,即要求使用的方法足以显示低丰度mRNA;(2)重复性要好;(3)实验过程中能够步步验证比较(side-by-side comparison);(4)得到的产物能代表相应的mRNAs或cDNAs,并能由此找到相应的cDNA 序列;(5)省时,简便易行。

既往对mRNA的比较研究中多用减数杂交方法[4](subtraction hybridization),该方法灵敏,可显示低丰度RNA,但是步骤复杂,需时较长,而且在得到最终结果前无法步步验证对照比较,故不易重复,并且需要大量的RNA作起始研究材料。这一点对RNA来源不易者(如手术活检标本)极不利[5,6]。

DD的优点在于:(1)仅需0.2 μg总RNA作为起始材料;(2)可同时分析多组样品;(3)敏感性高,可检出低丰度mRNA;(4)实验周期短,约8天即可完成[7],便于重复;(5)最突出的优点是实验过程中可步步验证比较。可简单地将DD的特点概括为“3SRV”,即“Simplicity,Sensitivity,Speed,Reproducibility,Versatility”。

DD方法因有上述优点,被广泛应用。例如:Musholt等[8]应用DD方法对手术切下的髓样甲状腺癌标本与局部转移的淋巴结进行了比较,发现了两个新的表达基因MDF-1和MDF-2,并认为这两个基因在髓样甲状腺癌的进展与转移中起了重要作用;Zuo等[9]研究溃疡

[1] [2] [3] [4] [5]

篇3:差异蛋白质组学的分离鉴定技术

差异蛋白质组学的分离鉴定技术

文章综述了差异蛋白质组学中主要分离技术如双向电泳、差异凝胶电泳、多维色谱技术及以质谱为基础的`分离鉴定技术.

作 者:喻小燕 陈锋菊  作者单位:喻小燕(湖南信息职业技术学院;湖南师范大学)

陈锋菊(湖南师范大学;湖南科技大学)

刊 名:科技信息(学术版) 英文刊名:SCIENCE & TECHNOLOGY INFORMATION 年,卷(期): “”(34) 分类号:Q5 关键词:差异蛋白质组学   蛋白质分离   蛋白质鉴定  

篇4:不同生育期水稻耐冷性的鉴定及耐冷性差异的生理机制

不同生育期水稻耐冷性的鉴定及耐冷性差异的生理机制

以粳稻9516、H45、武育粳、转PEPC基因水稻、Kitaake、苏沪香粳,籼稻扬稻6号、香籼、IR64,培矮64S以及杂交稻粤优938、汕优63、X07S/紫徽100、两优培九共14个水稻品种为材料,分别鉴定了芽期(胚根1 cm, 胚芽0.5 cm)、苗期(三叶)和孕穗期的耐冷性,同时选取南京对水稻播种敏感的自然低温条件,进行低温鉴定.结果表明,芽期存活率、苗期的枯死率和孕穗期结实率均为可靠的水稻耐冷性鉴定指标.进一步从叶片的光合速率、PSⅡ光化学效率(Fv/Fm)、脂肪酸组分、活性氧指标(丙二醛、过氧化氢和超氧阴离子)和抗氧化物质(抗坏血酸和谷胱甘肽)的.变化等方面,研究耐冷性不同的水稻的耐冷生理机制.表明耐冷的水稻品种武育粳含较多的不饱和脂肪酸,在低温逆境下,膜的流动性愈大,低温对其伤害愈小.对杂交稻汕优63而言,其叶内抵御逆境的保护系统抗坏血酸和谷胱甘肽的循环被较大地激活,特别是谷胱甘肽再生的高速运转,与不耐冷的品种香籼相比,汕优63叶内的过氧化物质累积较少,其耐冷性表现中等.认为水稻叶片维持高的脂肪酸不饱和指数和谷胱甘肽的周转循环能力是水稻耐冷的重要特征.

作 者:李霞 戴传超 程睿 陈婷 焦德茂 LI Xia DAI Chuan-Chao CHENG Yu CHEN Ting JIAO De-Mao  作者单位:江苏省农业科学院农业生物遗传生理研究所,江苏南京,210014 刊 名:作物学报  ISTIC PKU英文刊名:ACTA AGRONOMICA SINICA 年,卷(期): 32(1) 分类号:S511 Q945.11 关键词:水稻   耐冷性   生理基础  

篇5:mRNA差异显示技术及其在园艺植物上的应用(综述)

mRNA差异显示技术及其在园艺植物上的应用(综述)

mRNA差异显示技术是鉴别基因差异表达方法之一,已在生物技术相关领域中广泛应用.本文介绍mRNA差异显示技术的基本原理及主要优缺点,较详细地综述了该技术在园艺植物生物技术方面的'最新应用状况及取得的研究结果.

作 者:刘凯 曾继吾 夏瑞 黄永红 陈金印 易干军 LIU Kai ZENG Ji-wu XIA Rui HUANG Yong-hong CHEN Jin-yin YI Gan-jun  作者单位:刘凯,LIU Kai(广东省农业科学院,果树研究所,广东,广州,510640;江西农业大学,农学院,江西,南昌,330045)

曾继吾,夏瑞,黄永红,易干军,ZENG Ji-wu,XIA Rui,HUANG Yong-hong,YI Gan-jun(广东省农业科学院,果树研究所,广东,广州,510640)

陈金印,CHEN Jin-yin(江西农业大学,农学院,江西,南昌,330045)

刊 名:亚热带植物科学 英文刊名:SUBTROPICAL PLANT SCIENCE 年,卷(期): 38(1) 分类号:Q-33 S6 关键词:mRNA差异显示技术   园艺植物  

篇6:帝国CMS根据不同会员组显示不同内容的方法

这篇文章主要为大家介绍了帝国CMS根据不同会员组显示不同内容的方法,可通过帝国CMS自带的getcvar(‘mlgroupid‘)方法读取用户所在会员组进而判断选择不同显示内容,需要的朋友可以参考下

代码如下:

if(getcvar(‘mlgroupid‘)==1)

{

?>

//会员组id=1时显示内容

}

elseif(getcvar(‘mlgroupid‘)==2)

{

?>

//会员组id=2时显示内容

}

?>

希望本文所述对大家的帝国CMS建站有所帮助,

下载不同方法鉴定差异显示技术RAP-PCR得到差异基因的比较(精选6篇)
不同方法鉴定差异显示技术RAP-PCR得到差异基因的比较.doc
将本文的Word文档下载到电脑,方便收藏和打印
推荐度:
点击下载文档
最新范文更多
    热门文章
      猜你喜欢
      点击下载本文文档